感染人之前在动物宿主发生自然选择
新冠肺炎疫情最早期确诊的患者多数与武汉海鲜市场有交集,后有研究报道指出SARS-CoV-2的核酸序列与分离于蝙蝠的RaTG13毒株的核酸序列相似度高达96%:这都能让人联想到SARS-CoV-2可能源于动物。
此前的研究显示,RaTG13毒株刺突蛋白ACE2受体结合区域的6个关键氨基酸只有1个与SARS-CoV-2的相同,而分离于穿山甲的SARS-CoV样冠状病毒(SARS-CoV-like coronaviruses)的6个关键氨基酸与SARS-CoV-2的完全相同。
本文作者指出,从这个角度来讲,SARS-CoV-2的前体可能在动物体内进行了自然选择,最后获得和与人体细胞高度亲和的能力。
但是,当前分离于蝙蝠和穿山甲的SARS-CoV样病毒均缺失S1和S2之间的多元切割位点。有报道也证实,冠状病毒S1和S2编码核酸之间能够发生碱基突变、插入和缺失,那么这个多元切割位点就可能通过自然进化的方式产生。
作者认为,我们之所以现在没有从动物身上找到令人信服的SARS-CoV-2前体病毒可能是因为动物冠状病毒种类繁多,我们目前的采样量严重不足。
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